Výuka předmětu Anatomie II navazuje na výuku předmětu Anatomie I. Zabývá se stavbou a funkcí nervového systému (centrálního a periferního, a to především s ohledem na funkci pohybového aparátu), stavbou a funkcí vnitřních orgánů (především s ohledem na jejich vliv na funkci pohybového aparátu). Zvláštní pozornost je věnována nervově reflexnímu propojení vnitřních orgánů s pohybovým aparátem jako podklad pro viscerovertebrální a vertebroviscerální vztahy.